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协同育人的有效运行，需要做好以下几方面工作：
首先需要构建一个既能保证人才培养环节质量可控、满足教育主管部门和学科专业方向基本条件，同时又能保证高校以外的各主体能充分参与，实现人才培养定位和目标适应社会和企业实际需求的有效机制。为此，学校先后在专业学位硕士研究生培养方案、综合考核、校外实践基地建设与管理、职业能力培养高端讲座资助、精品课程和教材资助等方面出台一系列措施，在政策上予以保障。
其次，协同育人平台是保证协同育人机制稳定推进的最基本要素。从比较视野来看，世界各国已经通过摸索形成了一系列协同培养组织模式，例如大学科技园、工程研究中心、教学实验基地、共建研发中心、战略联盟等。深圳大学以工程硕士校外实践基地建设为抓手，以中外联合实验室和产业园区为补充，以项目合作为纽带，目前已建成工程硕士院级实践基地200余家，校级实践基地19家，省级实践基地4家，国家级实践基地1家。此外，我校还探索与行业协会、产业基地开展工程硕士的联合培养。
第三，资金和措施保障是确保协同育人机制稳定和有效推进的必要条件。为此需要确立稳定的协同育人机制的资金投入渠道，同时也需要发挥多方积极性，形成政府、学校、企业与其他协同单位联合共建的机制。深圳大学开展工程硕士课程教学案例建设，对全校46门工程硕士课程教学案例进行立项资助，资助总额100余万元。与此同时，各院系也积极拓展与企业共建实验室(中心)，加强对案例教学和实践基地的建设与投入力度。
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